一般醫院手術室層留凈化空調系統按照設備設置情況可以分為三類，分別是集中式、半集中式和分散式系統，在現階段大多數醫院使用的都是集中式空調系統。集中式空調系統由冷站系統和凈化系統組成，冷站系統為凈化系統提供熱源或冷源，通過熱水或冷水經過表冷器對空調機組的空氣進行加熱或降溫；凈化系統由空調機組和送回風管道系統組成。

手術室層流凈化空調系統的設計原則一般情況下要滿足以下三點需求。

（1）手術室的凈化空調系統應與其輔助用房的空調系統分開設置。

（2）對于I級潔凈手術室和II級潔凈手術室要分別采用獨立的凈化空調系統對室內空氣進行調節控制處理。

（3）III級潔凈手術室和IV級潔凈手術室可以多間手術室共用一個凈化空調系統，但系統的新風應該滿足既可以采用集中處理方式，也可以采用各個分系統單獨處理模式，形成各個手術室完全獨立的凈化空調系統。潔凈手術室通常都是采用多機集中式空調系統，系統包括新風機組、多臺循環空調機組、排風機組等并將所有的機組集中安裝在空調機房中，后由安裝在送風管末端手術室頂部的高校過濾器過濾后送入手術室內。