由于環氧乙烷易燃、易爆，且對人有毒，所以必須在密閉的環氧乙烷滅菌器內進行。

https://www.anjiuyiliao.com/sy及其應用：1.目前使用的環氧乙烷滅菌器種類很多，大型的容器有數十立方米，中等的有1～10立方米，小型的有零點幾**1立方米。它們各有不同的用途。2.大型環氧乙烷滅菌器：一般用于大量處理物品的滅菌，用藥量為0.8kg/m～1.2kg/m，在55℃～60℃下作用6h。3.中型環氧乙烷滅菌器：一般用于一次性使用環氧乙烷殺菌氣體滅菌時，滅菌柜內的溫度、濕度、滅菌氣體濃度、滅菌時間都是影響滅菌效果的重要參數。環氧乙烷是一種烷化劑，穿透力強，能夠使用各種包裝材料并且可以在包裝狀態下滅菌，在常溫下能殺滅各種微生物（包括細菌、芽孢、病毒、真菌孢子等），適用于不耐高溫處理的生物醫用高分子材料，比如天然橡膠、聚乙烯、聚丙烯及聚氯乙烯等。環氧乙烷滅菌器包括一個防泄漏、防爆炸的斷橋鋁鋼制腔室，首先通過加熱（預處理）過程，調節腔內的物料溫度和濕度，然后進一步抽真空，再通入經過預熱的環氧乙烷氣體。包裝材料必須是對空氣、蒸汽及環氧乙烷滲透性良好的，這樣容易達到適宜的滅菌條件。由于環氧乙烷具有潛在的致癌性、致突變性、急性毒性反應，為了工作人員的安全，應在滅菌過程中，嚴密監控大氣濃度和腔室的溫濕度、壓力、環氧乙烷氣體濃度及滅菌時間。滅菌效果通常使用生物指示劑來監控。滅菌器的控制具有一定難度，整個滅菌過程應在技術熟練人員的監督下進行。滅菌處理后，應通入過濾后的無菌空氣，經歷真空空氣循環過程，使殘留環氧乙烷安全去除。